当重要的培育污染时，研究者或许企图消除或操控污染。首要，确认污染物是细菌、真菌、支原体或酵母，把污染细胞与其它细胞系隔离开，用试验室消毒剂消毒培育器皿和超净台，查看HEPA过滤器。
高浓度的抗生素和抗霉菌素或许对一些细胞系有毒性，因而，做剂量反应试验确认抗生素和抗霉菌素发生毒性的剂量水平。这点在运用抗生素如两性霉素B和抗霉菌素如泰乐菌素时特别重要。下面是引荐的确认毒性水平缓消除培育污染的试验过程。
1 .在无抗生素的培育基中消化、计数和稀释细胞，稀释到常规细胞传代的浓度。
2 . 涣散细胞悬液到多孔培育板中，或几个小培育瓶中。在一个浓度梯度范围内，把挑选抗生素加入到每一个孔中。例如，两性霉素B引荐下列浓度，0.25，0.50，1.0，2.0，4.0,8.0 mg/ml。
3 .每天观测细胞毒性目标，如脱落，出现空泡，汇合度下降和变圆。
4 . 确认抗生素毒性水平后，运用低于毒性浓度2－3倍浓度的抗生素的培育液培育细胞2－3代。
5 . 在无抗生素的培育基中培育细胞一代。
6 .重复过程4。
7 . 在无抗生素的培育基中培育4－6代，确认污染是否以已被消除。
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